從體育科學的角度來看，比較適合跑步的時間是在下午。
但是，考慮到具體的情況，我們只能說沒有絕對的最佳跑步時間，只有最適合的時間。
每個人都有自己的習慣和作息時間，要考慮到家庭生活、學習和工作等因素。 堅持跑步的習慣比刻意選擇跑步的最佳時間更重要。
晨跑和夜跑的區別還是很大的。 一方面，外部環境確實不同，另一方面，個人身體狀態也會不同。

晨跑的利與弊
如果你起得夠早，在城市中大多數人還沒有醒來的時候就開始跑步，戶外相對安靜、空曠的街道給人以更廣闊的跑步空間，不同於平時喧囂的人群，可以提供一個更舒適的跑步環境。 但此時身體機能處於較差的狀態，人體溫度低造成肌肉僵硬，肺部功能差，從生理狀態來看，晨跑並不是很適合。
對大多數人來說，早起是一件相當痛苦的事情，更何況是晨跑，但同時也證明晨跑對增強我們的意志和提高精神力量有相當大的好處。
同時，與一天中的其他時間相比，晨跑會釋放更多的內啡肽。 這可以緩解壓力，增強愉悅感，感受快樂，享受獨處的時光。
一項針對高血壓前期患者的研究證明，早上7點運動時，白天血壓下降10%，晚上下降25%，說明晨跑對高血壓患者更友好，對降低血壓的效果更明顯。

以上更多的是從生理和心理狀態來解釋晨跑的，但從生理角度來看，晨跑也有一些弊端。
首先，當你在早晨醒來時，幾乎所有的身體機能都處於較差的狀態——身體的體溫較低，導致肌肉僵硬，也就是說，在跑步時需要注意身體的肌肉控制和協調能力控制，因此更需要在晨跑前進行動態熱身，以減少晨跑時受傷的風險。
其次，身體經過一夜的運轉，如果空腹晨跑容易誘發低血糖和脫水，所以晨跑前要適當補充能量和水分，防止意外發生。
由於早晨起床後心率會降到一天中最低的靜息心率，開晨跑會使心率變異達到最大，對心臟產生很重的負擔，心臟和心血管不好的跑者建議避免在這個時間段跑步。

夜間跑步的優勢和劣勢
夜晚的環境似乎更複雜，空氣中的含氧量更高，空氣質量較好，但人和車較多，同時視線和光線也不如白天好，所以夜跑時要注意安全。
與清晨不同，夜間人體有最適合運動的體溫，柔韌性、肌肉力量、心肺功能達到一天中的最佳狀態。
人體在夜間有較高的體溫，當體溫上升到合適的範圍內時，神經傳導速度加快，有較快的反應，同時肌肉和肌腱的靈活性和收縮力增強，大大降低了身體受傷的風險。
人體在夜間有較高的體溫，當體溫上升到合適的範圍內時，神經傳導速度加快，有較快的反應，同時肌肉和肌腱的靈活性和收縮力增強，大大降低了身體受傷的風險。
選擇飯後跑還是飯前跑要看個人的時間安排，如果是飯前跑，可以選擇跑完後休息半小時再吃飯；如果夜跑安排在飯後，大家都知道吃完飯不能馬上運動的常識，所以建議間隔時間至少1小時，等不覺得飽就可以開始夜跑。
夜跑結束後，休息20分鐘再洗澡比較合適，此時體溫恢復正常，汗液基本蒸發，血液恢復正常流動，這是一個比較科學和安全的洗澡時間段。
如果馬上洗澡會使皮膚中的血液流量繼續增加，會使肌肉繼續處於緊張狀態，身體更加疲勞。
沒有必要擔心運動是否會影響睡眠質量。 芬蘭於韋斯屈萊大學的一項心理學研究表明，睡前運動不會影響睡眠質量，但會使心率在睡前幾小時處於較高值，建議在睡前1-2小時結束運動。
但睡眠不足非常影響運動表現。